No sé dónde te quieren cobrar 5000€ por hacer el motor. Lo que normalmente se cambia son los elementos con más desgaste: segmentos, casquillos, tornillos de biela (que no queda otra) y todas las juntas. Yo hice el motor de mi antigua R6, cambiando lo que te he comentado más pistones (porque uno estaba una décima fuera de tolerancias y me quedaba yo más tranquilo) y me valió menos de la mitad de lo que te han dicho. Depende de cada marca el recambio vale algo más o algo menos, pero vamos, con 5000€ tienes un motor nuevo. Literalmente:
https://yart7.com/?product=yzf-r6-2017-spareengine
Sobre con cuántos kilómetros hay que hacerlo, depende de si está apretado el motor, y el cuidado que se haya tenido con temperaturas y aceites. Yo lo hice porque la moto cumplía 10 años de uso exclusivo en circuito (así que serían unos cuantos más kms de los que indicas) y por tranquilidad mía, porque iba a usar la moto para correr, y la conclusión fue... que me lo podía haber ahorrado
![Colleja](https://www.todocircuito.com/foro/images/smilies/taptap.gif)
no había ningún casquillo marcado ni cerca de romper, todos los componentes del cambio estaban perfectos... eso sí, luego iba con motor nuevo y perfectamente ajustado.