La power commander va conectada sobre los inyectores, el quickshifter va conectado a las bobinas, por lo tanto no tiene que haber ninguna incompatibilidad.
Otra cosa es si usas el módulo de cambio rápido del power commander ya que creo que es un módulo de expansión de la power commander y actúa sobre los 8 inyectores cortando la inyección para hacer el cambio de marchas.
4 inyectores van por los conectore de la power commander y los otros 4 por el módulo del cambio rápido.
Lo que no puedes hacer de ninguna manera es conectar el sensor de la palanca de cambios directamente al módulo de la power commander y activar el cambio rápido, ya que entonces no vas a cortar al 100% la transmisión de potencia del motor al cambio ya que quedarán 4 inyectores funcionando.
En mi opinión mejor uno independiente por las bobinas, ya que es operativo por si solo sin necesidad de nada.
Si compras el módulo de expansión de la power commander y está se te rompe el módulo de expansión por si solo no sirve de nada.