Como tu dices las 1000 son para rectas, para paso por curva se va mas rápido con 600.
Y yo sinceramente entro al circuito para ir rodilla al suelo contre mas rato mejor, no para ponerme a 300 en la recta.
La 1000 cansa mas, es mas exigente que las 600 y tienes que frenar antes.
La 600 te puedes pasar por la piedra a las 1000 en frenada en paso por curva etc, y con el control de tracción de la R6 que nombras puedes ir mas fuerte con tranquilidad.
También depende los circuitos a los que vayas, aquí en Cataluña solo vale la pena una 1000c en Montmeló y tampoco, porque con la 1000 te haces casi todo el circuito en 3ª-4ª. en el resto de circuitos van mejor las 600cc.