Lo primero es saber lo que se quiere de la moto al cambiar el escape. Si es solo por estetica y peso yo nunca cambio el filtro de aire ya que desajustaré mas la mezcla de aire-gasolina consiguiendo que en reducciones sea mas bruscas las detonaciones e incluso vaya peor la motocicleta.
Si es para buscar potencia lo ideal sería que cambiaras colectores-escape y filtro de aire con lo que tendrás que ajustar la injeccion con un Power Comander por ej. para buscar mas potencia pero ajustando bien la mezcla gasolina-aire y lo mejor seria en un banco para comprobar la ganancia en caballos y seria unos 5-8 caballos no mas
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no os creais que da 15 o 20 cv como suelen decir muchos por ahí. Yo me troncho cuando los oigo decir semejante aberración pues entienden de mecanica lo que yo de.......
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Resumiendo si solo cambias el silencioso yo dejaria el filtro de aire original pues la moto iré igual de bien que con el original pero ganando en peso y estetica.