Va, pues al final le he cambiado la bomba de la gasolina. 836€ me pedían en Yamaha, así que conseguí una a través de wallapop que estaba nueva y el chico aseguraba que era la original aunque a mi me da que es China. Es exacta a la original salvo por un pequeño detalle y el filtro que venía no era el de mi moto y tuve que poner el viejo.
También he aprovechado a limpiar filtro de aire, que no estaba muy sucio pero ya puestos a desmontar deposito lo tenía ahí.
Resultado: Un tanto desconcertante

sigue haciendo ese "corte" que hacía pero yo creo que ahora es menos brusco aunque puede que sea porque sube más lento de revoluciones y por eso se nota menos.
No se, estoy por volver a la bomba original y probar ¿cambiar bujías?