Las vibraciones que dices en frenada pueden ser causadas por varios motivos el neumatico no suele ser uno de ellos ni los discos de freno tampoco tal y como describes que te pasa
lo mas normal:
me ha pasado varias veces con distintas motos
pastillas de freno defectuosas
suspension defectuosa hay algun problema en alguna de las barras
rodamiento de la rueda en mal estado
Me ha llegado a pasar incluso cambiando la llanta y seguir teniendo el problema en ese caso fueron las pastillas de freno
si la pinza de freno es de pastillas diferenciadas osea dobles solo con que una pastilla salga mala o sea tenga un mal acople puede producir esa vibracion final
el rodamiento de la rueda tambien causa ese efecto si esta un poco defectuoso