buenas.
yo los limpio con una lija de grano fino, de agua o p360 +-.
cortas una tira de lija y sacando un poco los pistones, se hace bien. los pistones giran, asi que con un alicate o picoloro puedes ir girandolos para limpiarlos bien.
si vas a cambiar liquido de frenos, o purgar, te recomiendo meter los pistones en la pinza, ya que suele quedarse algo de aire en la pinza, despues de darles caña o al pasar bastante tiempo.
aqui un ejemplo de como se quedan los pistones limpios y como estan sucios (el de arriba a la izqda es el sucio

)