Ha probado de mirar el consumo del inyector con la pinza anperimétrica?
Con la amperimétrica mides el consumo del inyector, si es igual en los 4 descarta inyector.
Cambia las bobinas de un cilindro a otro. Si el fallo persiste puede se de motor. Mira compresiones, no vaya a ser que tengas un cilindro ko.
De motos no tengo mucha idea pero de coches me he comido mas de un marrón de estos.
Suerte con la búsqueda y espero que no sea nada grabe.
Perdón, se me olvidaba. Desconecta centralita e inyector y comprueba continuidades de la instalación. Entre cables, y entre cables y masa, no vaya a ser que tengas uno derivado a masa.
Mi cabeza no para...

A veces los enchufes dan malas pasadas, sin carga hay continuidad, pero en carga fallan. Me he encontrado que al mirar voltajes sin conectar al componente tienes 12 v pero al conectar cae la tensión por conectores sulfatados, cables seccionados y mil cosas mas.